44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2246 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2246  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  221  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00449361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2448  rhodanese-like protein  48.08 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38806  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6200  rhodanese-like protein  45.24 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5758  manganese and iron superoxide dismutase  43.37 
 
 		 308 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1205  putative superoxide dismutase  40.22 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0474205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2676  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0093  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1047  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2502  manganese and iron superoxide dismutase  32.94 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3338  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3132  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2657  rhodanese-like protein  32.91 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1744  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  37.78 
 
 		 328 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.48 
 
 		 392 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  31.13 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  38.98 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  31.13 
 
 		 330 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  28.28 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  29.29 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  27.36 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0743  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 397 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 		 395 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  30.48 
 
 		 334 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1752  Rhodanese domain protein  27.18 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.708462  normal  0.834811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1474  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 		 656 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.42 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  25.25 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  32.91 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 459 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 		 398 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  28.12 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0045  sulfur/pyrite/thiosulfate/sulfide-induced protein  37.25 
 
 		 215 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0046  Rhodanese domain protein  37.25 
 
 		 215 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 460 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>