38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2236 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00052496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1918  hypothetical protein  49.74 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1329  hypothetical protein  49.22 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000084248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3511  hypothetical protein  48.69 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.032237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1224  hypothetical protein  48.69 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3058  hypothetical protein  47.12 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.560727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3045  hypothetical protein  47.64 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0684193  normal  0.064604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  39.36 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  37.43 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3049  hypothetical protein  37 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1624  hypothetical protein  36.52 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0393  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0217  hypothetical protein  32.12 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2335  hypothetical protein  28.02 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4354  hypothetical protein  36.54 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1820  hypothetical protein  24.23 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2489  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0783  hypothetical protein  30.27 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.253849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2949  hypothetical protein  26.37 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00866595  normal  0.610855 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4291  hypothetical protein  26.52 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0889  hypothetical protein  24.37 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000461408  hitchhiker  0.0000000000715277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1846  hypothetical protein  28.19 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0053  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7701  hypothetical protein  28.65 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314158  normal  0.154881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1961  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0685791  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  26.28 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf136  hypothetical protein  21.69 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0300138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  24.23 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0753  hypothetical protein  19.68 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0201  hypothetical protein  23.39 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0339  hypothetical protein  31.73 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.109845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0952  hypothetical protein  30.63 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0714  hypothetical protein  30.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.402815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3787  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2691  hypothetical protein  32.67 
 
 		 203 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4655  hypothetical protein  34.62 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2172  hypothetical protein  31.68 
 
 		 167 aa  41.6  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>