More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1914 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  69.86 
 
 
220 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  65.3 
 
 
220 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  43.66 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 
221 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  41.06 
 
 
207 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  37.96 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.09 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  33.02 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  32.55 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  38.24 
 
 
249 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  38.73 
 
 
249 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  34.11 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.55 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  28.91 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  32.35 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  31.86 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  31.86 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  32.35 
 
 
203 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  32.35 
 
 
203 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 
222 aa  92  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  33.82 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  31.86 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  31.86 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  31.86 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  28.37 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  31.03 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.28 
 
 
230 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  27.88 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  31.48 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  30.05 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  30.92 
 
 
221 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  31.73 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.58 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  29.58 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.07 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  29.11 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0992  glutathione S-transferase-like transmembrane protein  31.13 
 
 
360 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644569  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  35.12 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1623  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  29.73 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  28.83 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  29.58 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  28.97 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.17 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  30.39 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  34.1 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  28.17 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  30.96 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  31.32 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  27.7 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  33.53 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2340  glutathione S-transferase  32.06 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0809017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  33.51 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  28.77 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  30.73 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  30.05 
 
 
204 aa  79  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  30.22 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  29.86 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  33.49 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.07 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7338  glutathione S-transferase-like protein  29.95 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475649  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  27.15 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.17 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  34.1 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  32.08 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  26.76 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  33.72 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  30 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.02 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  31.53 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  29.76 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  29.44 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  26.29 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>