146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1573 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  63.94 
 
 		 269 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  67.79 
 
 		 268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  67.04 
 
 		 268 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  66.04 
 
 		 268 aa  352  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  63.57 
 
 		 269 aa  347  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  62.64 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  63.02 
 
 		 267 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  61.89 
 
 		 267 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  62.64 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  46.79 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  42.8 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  44.27 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  44.92 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  41.2 
 
 		 390 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  44.93 
 
 		 616 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  42.75 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  38.58 
 
 		 366 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  43.17 
 
 		 371 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  42.54 
 
 		 662 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  38.43 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  41.04 
 
 		 605 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  40.3 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  44.4 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  40.89 
 
 		 369 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  40.52 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  40.89 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  40.89 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  40.89 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  40.89 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  40.89 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  41.42 
 
 		 367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  40.89 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  41.64 
 
 		 369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  39.93 
 
 		 367 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  40.52 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  41.64 
 
 		 369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  41.64 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  41.26 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  41.64 
 
 		 369 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  40.3 
 
 		 367 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  39.1 
 
 		 605 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  35.29 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  42.16 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  39.55 
 
 		 369 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 370 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 370 aa  178  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  39.18 
 
 		 367 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  40.34 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  42.12 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  37.59 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  39.45 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  39.19 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  39.7 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  40 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  38.91 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  37.73 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  36.75 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3673  MOSC domain-containing protein  37.81 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  36.75 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  39.77 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  38.81 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  36.4 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  36.4 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  37.41 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  40.8 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  40.36 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  39.43 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1722  MOSC domain-containing protein  38.04 
 
 		 416 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0687765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  37.09 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1041  mosc domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  34.65 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1125  MOSC domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2279  MOSC domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  39.54 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  39.54 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0954  mosc domain-containing protein  37.41 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0292187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  39.85 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  36.63 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  34.57 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  36.79 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  36.64 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  36.46 
 
 		 301 aa  131  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.59 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  33.19 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  32.73 
 
 		 302 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0116  MOSC domain-containing protein  36.16 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  36 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  26.84 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46641  predicted protein  29.14 
 
 		 1036 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335573  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  27.94 
 
 		 342 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  30.88 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  25.45 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  29.77 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  27.4 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  28.89 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01637  Molybdenum cofactor sulfurase (MoCo sulfurase)(MOS)(EC 4.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9UV64]  25.62 
 
 		 839 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  31.33 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  31.84 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  33.11 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>