33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1030 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  36.4 
 
 
266 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.39 
 
 
263 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  25.56 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  26.36 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  27.72 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  26.84 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  26.84 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  26.84 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25.22 
 
 
265 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  23.81 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  24.17 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  26.23 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  28.28 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  26.63 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  26.63 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  19.8 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  24.44 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  25.21 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  23.9 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  22.44 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  21.88 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  22.34 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  19.91 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  26.84 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  26.15 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  19.12 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  26.14 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  26.73 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  20.18 
 
 
267 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  25.63 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  20.21 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  26.32 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>