More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3682 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3682  flagellar basal body FlaE domain protein  100 
 
 		 562 aa  1097    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  28.2 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.51 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.66 
 
 		 501 aa  143  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  27.67 
 
 		 556 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  40.57 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  28.14 
 
 		 601 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  37.43 
 
 		 814 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  35.75 
 
 		 819 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 442 aa  114  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  31.85 
 
 		 750 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  31.85 
 
 		 623 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  33.21 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.29 
 
 		 508 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  36.49 
 
 		 718 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  48 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  36.25 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  35.12 
 
 		 702 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  37.93 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  33.08 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  33.08 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 		 413 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  36.46 
 
 		 705 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  36.87 
 
 		 851 aa  106  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.78 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  36 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  37.58 
 
 		 845 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  33.47 
 
 		 442 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  42.75 
 
 		 441 aa  104  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  30.18 
 
 		 417 aa  103  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  33.51 
 
 		 911 aa  103  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.82 
 
 		 419 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  36.94 
 
 		 838 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.04 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.51 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  43.26 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.57 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.88 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  33.99 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  30.32 
 
 		 400 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1541  flagellar hook protein FlgE  36.31 
 
 		 437 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  38.85 
 
 		 410 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  31.35 
 
 		 401 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1119  flagellar basal body rod protein FlgG  44 
 
 		 264 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.32 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  31.35 
 
 		 401 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  32.07 
 
 		 503 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  32.62 
 
 		 475 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  35.09 
 
 		 875 aa  97.4  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 405 aa  97.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.36 
 
 		 488 aa  97.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  29.8 
 
 		 814 aa  96.7  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  38.31 
 
 		 401 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.57 
 
 		 808 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  41.1 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1366  flagellar hook protein FlgE  36.02 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.84 
 
 		 431 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.86 
 
 		 401 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1751  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 437 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1568  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 437 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1530  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 437 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.18 
 
 		 442 aa  94.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1686  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 437 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  32.97 
 
 		 770 aa  94.4  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  37.58 
 
 		 440 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  30.12 
 
 		 414 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  39.39 
 
 		 856 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  30.12 
 
 		 414 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  30.12 
 
 		 414 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.01 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  30.87 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  31.22 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.55 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.68 
 
 		 525 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.01 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  37.95 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  32.42 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 414 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  28.83 
 
 		 395 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  28.83 
 
 		 395 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3791  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.74 
 
 		 503 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  35 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  40.98 
 
 		 402 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.36 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.36 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  40.98 
 
 		 402 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  40.98 
 
 		 402 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>