47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3429 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  100 
 
 		 412 aa  825    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  25 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  37.8 
 
 		 115 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  40.3 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  26.17 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  33.94 
 
 		 117 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  27.32 
 
 		 188 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3822  transport-associated  32.84 
 
 		 210 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139226  hitchhiker  0.00915179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  40 
 
 		 178 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  25.6 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  33.33 
 
 		 113 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  29.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  24.56 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  26.37 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  29.65 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  26.56 
 
 		 217 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  38.96 
 
 		 119 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  26.04 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  23.12 
 
 		 181 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3849  transport-associated  37.68 
 
 		 115 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000819027 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  41.79 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  34.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  32 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  34.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4733  transport-associated  34.44 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  42.86 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  27.08 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  24.18 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  24 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0674  transport-associated  40.58 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  42.86 
 
 		 150 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  29.46 
 
 		 118 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  33.33 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.38 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  33 
 
 		 118 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  30 
 
 		 124 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  36.36 
 
 		 119 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  25.75 
 
 		 255 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  36.92 
 
 		 84 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  41.79 
 
 		 122 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 122 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  41.79 
 
 		 122 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  40.79 
 
 		 222 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>