114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2859 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  100 
 
 		 384 aa  778    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  30.29 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  32.79 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  32.46 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  32.39 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.75 
 
 		 325 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.05 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  31.05 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  29.29 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  32.39 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.19 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  33.76 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  33.19 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  31.38 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.19 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.19 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.19 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.19 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  32.22 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  30.33 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.77 
 
 		 323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.34 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  30.69 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  34.18 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  27.25 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  29.05 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  32.49 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.67 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  30.9 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  32.91 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  26.36 
 
 		 338 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  31.25 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  30.86 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  26.52 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  29.33 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  28.09 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  25.39 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  29.39 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  30.88 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  31.03 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  29.15 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  31.25 
 
 		 640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  31.27 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  30.8 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  29.08 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.9 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  28.62 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  31.93 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  27.72 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  30.71 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  30.09 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.88 
 
 		 336 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  30.71 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  28.75 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  31.58 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  27.07 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  26.64 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.95 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  25.54 
 
 		 328 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  29.72 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  28.02 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  28.34 
 
 		 370 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.79 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  26.1 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  26.64 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  25.25 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  23.08 
 
 		 331 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  25.25 
 
 		 349 aa  87  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  27.59 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  27.97 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  27.53 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  25.76 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  26.32 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  26.61 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.09 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  26.67 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  26.39 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.32 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.89 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  25.64 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  26.52 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  24.93 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  23.33 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  27.92 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  23.44 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.37 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  27.33 
 
 		 287 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  24.17 
 
 		 365 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.16 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  23.1 
 
 		 355 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>