More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2442 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2442  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 517 aa  1070    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 500 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 470 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 480 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 470 aa  375  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 458 aa  369  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 459 aa  369  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>