41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2212 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  984    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  29.23 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  28.67 
 
 		 491 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  28.44 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 472 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  27.48 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 482 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  26.57 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 476 aa  127  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 453 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 445 aa  86.7  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.18 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 450 aa  53.5  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  24 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  22.67 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>