More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0482 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0482  ribosomal protein L22  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  44.12 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0298  ribosomal protein L22  42.34 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.495087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  47.57 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  44.23 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  42.34 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  43.27 
 
 		 159 aa  93.6  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  40 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  46.49 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  44.55 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  41.96 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  41.51 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  40.37 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  43.81 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  38.6 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0039  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00472535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  41.18 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  41.12 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  41.96 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  42.31 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  44.04 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  42.98 
 
 		 281 aa  87.8  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  44.44 
 
 		 113 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  41.51 
 
 		 165 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1028  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000806813  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  39.81 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  39.32 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  44.04 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  47.06 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  38.39 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  40.19 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  40.19 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  38.26 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  40.95 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  40.74 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  40.38 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0847  ribosomal protein L22  36.84 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  41.28 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  42.31 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  39.29 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  42.2 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  43.12 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>