36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2596 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 82 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  45.57 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  53.25 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  41.89 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  44.16 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2561  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.44 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  39.19 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  34.18 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  53.19 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  35 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  43.33 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  54.05 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2738  transcriptional regulator, AbrB family  33.77 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.703017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  32.89 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 82 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3022  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.62 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  55.17 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  45.95 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 88 aa  40  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  66.67 
 
 		 82 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>