48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2386 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2386  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  903    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.164497  normal  0.439216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0801  hypothetical protein  45.56 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2148  hypothetical protein  37.61 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000428746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5456  hypothetical protein  34.79 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.186969 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1989  hypothetical protein  34.99 
 
 		 529 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6127  hypothetical protein  34.46 
 
 		 509 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0692  hypothetical protein  35.51 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2383  hypothetical protein  33.8 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0916169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0601  hypothetical protein  34.99 
 
 		 561 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1311  hypothetical protein  33.64 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.127112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1277  hypothetical protein  33.88 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1378  hypothetical protein  33.18 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294238  normal  0.306366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4543  hypothetical protein  32.94 
 
 		 492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277933  normal  0.737886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0918  hypothetical protein  32.94 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1400  hypothetical protein  32.94 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0191  hypothetical protein  32.71 
 
 		 487 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0897253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5727  hypothetical protein  31.55 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5830  hypothetical protein  31.7 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11907  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7012  hypothetical protein  31.31 
 
 		 488 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0419358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1483  hypothetical protein  31.31 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6346  hypothetical protein  31.31 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5613  hypothetical protein  31.24 
 
 		 491 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0706869  normal  0.469482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3350  hypothetical protein  32.33 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2407  hypothetical protein  32.33 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3144  hypothetical protein  33.18 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2880  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2333  hypothetical protein  37.28 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2395  hypothetical protein  30.92 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2054  hypothetical protein  31.82 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.254497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5591  hypothetical protein  31.57 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  34.09 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  29.52 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2219  hypothetical protein  31.61 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0363094  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3912  hypothetical protein  25.11 
 
 		 475 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2317  hypothetical protein  27.93 
 
 		 572 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0508  hypothetical protein  26.23 
 
 		 580 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1078  hypothetical protein  29.27 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0113368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0965  hypothetical protein  24.3 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0622  hypothetical protein  22.36 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000219002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4762  hypothetical protein  28.01 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3039  hypothetical protein  23.19 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0289115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01810  hypothetical protein  28.35 
 
 		 187 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0635  hypothetical protein  27.04 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4678e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01144  hypothetical protein  24.42 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2407  hypothetical protein  26.99 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1129  hypothetical protein  31.68 
 
 		 514 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0265862  normal  0.577843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>