33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0660 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4816  AbrB family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3351  AbrB family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4165  AbrB family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0253396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  64.1 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  64.1 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4259  AbrB family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  49.06 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4887  AbrB family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  44.44 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  37.88 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.82 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  50 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1055  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3235  transcriptional regulator, AbrB family  35.71 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3494  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0198  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000131897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2482  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1988  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 88 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000759874  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  41.18 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1154  transcriptional regulator, AbrB family  39.22 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134363  normal  0.0192222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  37.5 
 
 		 97 aa  40.8  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3694  AbrB family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>