63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1670 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  788    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  78.24 
 
 
387 aa  624  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  74.74 
 
 
389 aa  609  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  72.94 
 
 
389 aa  590  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  49.61 
 
 
380 aa  348  9e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  41.69 
 
 
377 aa  277  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  41.03 
 
 
357 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  38.97 
 
 
351 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.12 
 
 
324 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.91 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  27.49 
 
 
371 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  28.97 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  27.23 
 
 
370 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  26.63 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  29.19 
 
 
369 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  28.42 
 
 
369 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  26.34 
 
 
367 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  27.57 
 
 
369 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  27.57 
 
 
365 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  27.07 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  27.37 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  28.49 
 
 
369 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  43.27 
 
 
328 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  26.26 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  26.76 
 
 
363 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  28.42 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  29.11 
 
 
370 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  26.67 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  27.01 
 
 
346 aa  111  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  24.93 
 
 
368 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  25.59 
 
 
364 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  27.3 
 
 
407 aa  106  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  28.94 
 
 
311 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  27.78 
 
 
369 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  26.01 
 
 
367 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  38.32 
 
 
330 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  25.53 
 
 
367 aa  102  9e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  38.32 
 
 
330 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  38.32 
 
 
330 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  25.27 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  27.03 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  38.46 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  25.4 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  25.75 
 
 
368 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  28.78 
 
 
371 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  26.98 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2467  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.09 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  31.68 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  34.29 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  30.22 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  33 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  30.11 
 
 
364 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  29.81 
 
 
348 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  44.64 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  33.65 
 
 
346 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.55 
 
 
434 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  31.96 
 
 
299 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  28.15 
 
 
329 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  29.03 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  27.66 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  30.34 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  26.96 
 
 
364 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>