25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2785 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  645    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  64.88 
 
 		 300 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  60.2 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  60.4 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  42.01 
 
 		 1139 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  31.05 
 
 		 675 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  28.99 
 
 		 274 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.9 
 
 		 982 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.33 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  27.72 
 
 		 739 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  26.79 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  26.73 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  24.71 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  24.15 
 
 		 583 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  25.9 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  30 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  23.42 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  29.53 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  23.49 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.86 
 
 		 478 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  24.46 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.22 
 
 		 455 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  20.67 
 
 		 992 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  25 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>