52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1776 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.72 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3564  hypothetical protein  51.5 
 
 		 239 aa  238  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  23.65 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.6 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.32 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  22.42 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  28.8 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  26.12 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.84 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  22.22 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  29.32 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  20.25 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.03 
 
 		 289 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.34 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  28.03 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  25.98 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.83 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.48 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.1 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.424145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  22.79 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.64 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.71 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  29.27 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.24 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  25.31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.81 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  25.31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  25.31 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  22.18 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.06 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  23.93 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  26.95 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.75 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.37 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.78 
 
 		 257 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 		 251 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.98 
 
 		 257 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>