282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1450 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  54.97 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  44.86 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  41.75 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  39.69 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  38.54 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  37.57 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  32.62 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  34.9 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  34.78 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  34.52 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  34.76 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  31.79 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  26.74 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  27.47 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  26.74 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  26.34 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  26.2 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  26.2 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  26.2 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0173  nitroreductase  33.71 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  30.52 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  26.37 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  31.52 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  23.16 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  27.12 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  27.11 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  31.65 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  31.28 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  26.34 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.25 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  25.67 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  23.89 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  29.79 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  30 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  24.21 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0639  nitroreductase  26.97 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  28 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  28.75 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  28.57 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  27.12 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  33.33 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  31.17 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  28.12 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  28.75 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  24.38 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  27.18 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  29.56 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  28.35 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  28.9 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  26.52 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  29.66 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  27.98 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  28.92 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  29.88 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  22.78 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  25.81 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  25.71 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  29.75 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  26.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  24.31 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  26.53 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  26.42 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  27.92 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  25.52 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  22.67 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  22.56 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  28.85 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  24.83 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  27.14 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  27.14 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.76 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  27.86 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  21.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  27.16 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.52 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  26.34 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>