More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0973 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2130  amino acid permease-associated region  68.78 
 
 		 643 aa  832    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.345831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 651 aa  1319    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  59.67 
 
 		 561 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4823  amino acid permease-associated region  58.23 
 
 		 563 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  59.58 
 
 		 549 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  50.52 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.46 
 
 		 476 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  45.42 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  40.45 
 
 		 495 aa  340  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  41.51 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  43.02 
 
 		 476 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  43.02 
 
 		 476 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  38.98 
 
 		 471 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  334  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  334  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  39.06 
 
 		 471 aa  334  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  334  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 471 aa  334  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  38.77 
 
 		 471 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  39.7 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  39.48 
 
 		 471 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 		 495 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  41.2 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  41.2 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  41.42 
 
 		 471 aa  323  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  40.97 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  41.2 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.98 
 
 		 486 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  43.76 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  38.82 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 502 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  38.61 
 
 		 483 aa  320  6e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  39.48 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  39.27 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  39.27 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  39.27 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  41.2 
 
 		 495 aa  319  9e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  39.27 
 
 		 467 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  39.27 
 
 		 467 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  40.17 
 
 		 476 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 		 549 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  39.48 
 
 		 467 aa  316  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  39.48 
 
 		 471 aa  316  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 438 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  39.06 
 
 		 467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  36.9 
 
 		 486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  36.9 
 
 		 486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 465 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  39.22 
 
 		 467 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 467 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  41.13 
 
 		 466 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  40.37 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  37.61 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  37.61 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  37.61 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  37.01 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  39.83 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  38.65 
 
 		 478 aa  309  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  37.55 
 
 		 471 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  40.66 
 
 		 497 aa  306  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  41.25 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  42.69 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  41.16 
 
 		 489 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  39.71 
 
 		 480 aa  303  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  35.92 
 
 		 489 aa  303  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  39.79 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  38.03 
 
 		 477 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  37.47 
 
 		 486 aa  301  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  39.19 
 
 		 503 aa  300  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  37.39 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  39.22 
 
 		 460 aa  298  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  38.26 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  36.85 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 496 aa  296  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  36.97 
 
 		 471 aa  296  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  38.36 
 
 		 463 aa  296  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  36.97 
 
 		 471 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  37.18 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  38.36 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  39.83 
 
 		 464 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  37.4 
 
 		 489 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  40.04 
 
 		 467 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  36.75 
 
 		 471 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>