More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0947 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
180 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  63.13 
 
 
189 aa  249  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
185 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  44.44 
 
 
185 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  45.6 
 
 
184 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  43.33 
 
 
185 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
184 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  45.61 
 
 
189 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  42.46 
 
 
184 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  41.9 
 
 
183 aa  160  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 
184 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 
184 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 
184 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  43.02 
 
 
184 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 
183 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3211  NADPH-dependent FMN reductase  43.58 
 
 
186 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  44.07 
 
 
188 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  43.96 
 
 
185 aa  152  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  42.61 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  44.77 
 
 
185 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
192 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  42.29 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2303  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
187 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233945  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  41.57 
 
 
184 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 
185 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  44.32 
 
 
186 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
186 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  41.86 
 
 
185 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
186 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
184 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
184 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  41.14 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  43.64 
 
 
186 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
189 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  42.01 
 
 
185 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  40.68 
 
 
184 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.4 
 
 
187 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  42.29 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  42.68 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  43.68 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  38.51 
 
 
184 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  39.55 
 
 
184 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  39.44 
 
 
182 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  41.28 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  41.24 
 
 
189 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  40.68 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  39.11 
 
 
186 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  40.68 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  36.52 
 
 
203 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  36.87 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
184 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  38.95 
 
 
184 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  38.42 
 
 
183 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
183 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  39.77 
 
 
206 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  36.93 
 
 
183 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 
181 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  35.59 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  38.07 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  41.98 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  37.29 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1895  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0898095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  35.09 
 
 
190 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  37.21 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3311  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 
190 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  36.11 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  35.59 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  34.46 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  35.56 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  34.08 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  36.07 
 
 
188 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
220 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  33.89 
 
 
186 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
185 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2447  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
181 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
197 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
181 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0184  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
184 aa  102  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  35.93 
 
 
193 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  34.08 
 
 
187 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  34.1 
 
 
183 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
182 aa  97.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>