More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4355 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
314 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  67.52 
 
 
314 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  66.88 
 
 
314 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
314 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  67.52 
 
 
326 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  68.47 
 
 
314 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  66.67 
 
 
316 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  66.34 
 
 
316 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 
326 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  42.24 
 
 
304 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 
307 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 
307 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  38.59 
 
 
307 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  37.58 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  37.25 
 
 
307 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 
307 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  36.58 
 
 
307 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  36.58 
 
 
307 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  36.58 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  36.58 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  38.52 
 
 
308 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  38.87 
 
 
306 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  36.96 
 
 
313 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
310 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  37.09 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  39.5 
 
 
314 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  39.5 
 
 
323 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
314 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  36.48 
 
 
316 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  38.49 
 
 
312 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  36.59 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
324 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.43 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  38.1 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  29.93 
 
 
309 aa  171  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
305 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
305 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  33.8 
 
 
313 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
306 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  31.46 
 
 
301 aa  159  8e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  33.1 
 
 
310 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 
308 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
310 aa  155  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  32.65 
 
 
308 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  34.88 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
277 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
276 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  32.09 
 
 
279 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  32.09 
 
 
279 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  32.09 
 
 
279 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  34.83 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
279 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  29.7 
 
 
310 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  34.56 
 
 
288 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  26.16 
 
 
309 aa  105  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.05 
 
 
279 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  31.89 
 
 
265 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
284 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.92 
 
 
277 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  32.17 
 
 
274 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
275 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  30.88 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  30.85 
 
 
277 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  27.27 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  30.5 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.69 
 
 
279 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
267 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  27.87 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.67 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
294 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  27.69 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  27.96 
 
 
303 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
254 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
270 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  27.96 
 
 
303 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
255 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.52 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>