131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4300 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4728  hypothetical protein  67.16 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54030  hypothetical protein  67.16 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3733  hypothetical protein  58.66 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0289264  normal  0.0233298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1655  protein of unknown function DUF81  53.89 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1421  protein of unknown function DUF81  42.44 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  31.45 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  30.94 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.24 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.4 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.33 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.94 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.2 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.06 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.56 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.48 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  28.23 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  29.34 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.47 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  27.95 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.48 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.29 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.36 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.45 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  26.85 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  30.8 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  29.54 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  27.59 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  31.3 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  31.3 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  28.05 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  27.84 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  27.48 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  26.36 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.75 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  24.3 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  29.65 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.12 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  26.48 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  27.03 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  28.18 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  27.41 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  30.73 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  27.35 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  29.91 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  27.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  28.9 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  24.31 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  29.79 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  26.09 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  26.54 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  28.5 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  26.96 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  29.22 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  23.43 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  26.15 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  26.21 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  28.05 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  25.2 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  27.23 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  26.26 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.78 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0322  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  25.67 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  26.07 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.3 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  23.47 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2046  hypothetical protein  27.96 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.391203  normal  0.958911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  25.26 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  25.61 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  22.61 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  24.15 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  25.34 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>