235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3218 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.97 
 
 
197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  59.59 
 
 
199 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.46 
 
 
197 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  57.73 
 
 
205 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.41 
 
 
197 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.84 
 
 
244 aa  208  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.3 
 
 
219 aa  207  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.61 
 
 
213 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.61 
 
 
215 aa  204  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.26 
 
 
218 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.76 
 
 
218 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.33 
 
 
228 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  50.25 
 
 
246 aa  191  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  50.75 
 
 
218 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.26 
 
 
218 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  52.85 
 
 
218 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  50.24 
 
 
230 aa  188  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  51.02 
 
 
239 aa  185  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.06 
 
 
227 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  49.23 
 
 
213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  52.85 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.25 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.94 
 
 
221 aa  177  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  44.8 
 
 
242 aa  174  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.1 
 
 
218 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.4 
 
 
202 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.64 
 
 
225 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.58 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.99 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.49 
 
 
223 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  47.74 
 
 
223 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.61 
 
 
238 aa  167  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  45.41 
 
 
216 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  47.45 
 
 
221 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  47.45 
 
 
221 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  47.24 
 
 
223 aa  164  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.22 
 
 
323 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  48.45 
 
 
212 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.48 
 
 
223 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  49.75 
 
 
555 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  47.67 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.64 
 
 
221 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  46 
 
 
220 aa  158  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.96 
 
 
323 aa  154  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  42.93 
 
 
222 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  41.24 
 
 
224 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  42.93 
 
 
222 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  46.35 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  46.35 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  43.3 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  46.27 
 
 
333 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  51.27 
 
 
172 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  39.11 
 
 
219 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  37.86 
 
 
226 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  48.29 
 
 
221 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  38.61 
 
 
219 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.71 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  39.41 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  34.16 
 
 
219 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
227 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.98 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
234 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.33 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  30.48 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  30.65 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 
205 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.57 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.48 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  30.15 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  30.15 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  26.35 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  29.15 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  26.47 
 
 
228 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  27.27 
 
 
209 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  26.13 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.74 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  29.61 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.71 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  28.31 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  30.53 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  30.06 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  27.81 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.29 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  25.98 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  26.53 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.74 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.71 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>