49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2580 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3537  DinB family protein  63.16 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2200  hypothetical protein  62.63 
 
 		 193 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  63.16 
 
 		 192 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  48.89 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  47.92 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  51.12 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  48.02 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6943  DinB family protein  45.7 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1904  DinB family protein  33.94 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.574421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  31.18 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  31.07 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0809  DinB family protein  31.68 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0773  DinB family protein  30.23 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2065  DinB family protein  33.75 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  33.33 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  31.49 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1078  DinB family protein  28.33 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.119596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0713  DinB family protein  34.18 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0305942  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2321  hypothetical protein  31.68 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  30.94 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1895  DinB family protein  33.95 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00325432  normal  0.939187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3644  DinB family protein  31.76 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1222  DinB family protein  28.9 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3027  hypothetical protein  50.85 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0464615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2556  DinB family protein  29.63 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1077  DinB family protein  29.7 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703238  hitchhiker  0.000010908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1782  DinB  26.11 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0450632  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2382  DinB  30.23 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  normal  0.786609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3097  DinB family protein  26.7 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2288  DinB family protein  24.24 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1368  DinB family protein  27.61 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  28.85 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5169  DinB family protein  27.63 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  28.85 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  28.05 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  31.14 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1769  DinB family protein  28.57 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0979  hypothetical protein  25.83 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000162275  normal  0.0303129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6952  DinB family protein  25 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.78845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2771  DinB family protein  23.53 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1703  DinB family protein  24.38 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0905876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0178  DinB family protein  27.72 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0154  DinB  28.66 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0472  DinB family protein  30 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0271  DinB family protein  28.77 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2590  DinB family protein  21.05 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.142773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  27.5 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2370  DinB family protein  25.49 
 
 		 152 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00332574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>