More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1741 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  81.86 
 
 		 242 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  81.01 
 
 		 242 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  78.33 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  77.37 
 
 		 243 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  77.92 
 
 		 244 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  78.33 
 
 		 244 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  76.99 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  77.08 
 
 		 240 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  75.83 
 
 		 240 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  46.75 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  38.1 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  38.56 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  37.66 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  36.8 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  39.41 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.06 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  37.29 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  31.54 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  31.72 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.73 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  32.9 
 
 		 226 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  28.04 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  28.76 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  29.23 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  30.94 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  29.35 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  29.7 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  24.76 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  28.25 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  32.45 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  32.59 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  30.09 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  38.53 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  26.19 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  25.5 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  28.21 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  26.52 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  31.4 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  27.75 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  27.36 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  26.94 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  32.46 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  34.62 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  35.2 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  30.68 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  35.25 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  25.37 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  24.85 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  30.41 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  36.29 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  27.52 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.96 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.96 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  29.61 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  32.17 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  37.38 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  29.48 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  35.24 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  26.85 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  29.71 
 
 		 522 aa  59.3  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  26.79 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  35.24 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.1 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  27.22 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  27.22 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  37.17 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  34.62 
 
 		 507 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  26.23 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  34.29 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  32.08 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  31.18 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  23.58 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  32.48 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  33.63 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  35.71 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>