35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1443 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1443  putative lipoprotein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3789  putative lipoprotein  58.6 
 
 		 287 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0227546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1589  lipoprotein, putative  58.54 
 
 		 287 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4075  lipoprotein  59.43 
 
 		 289 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4564  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 286 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1325  hypothetical protein  56.43 
 
 		 286 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3865  lipoprotein  55 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1382  hypothetical protein  42.26 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300588  normal  0.327464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2199  putative lipoprotein  29.54 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0577  hypothetical protein  31.71 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0585  hypothetical protein  31.95 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2317  hypothetical protein  27.01 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1455  hypothetical protein  24.82 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1806  hypothetical protein  24.54 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1664  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3305  rare lipoprotein A  24 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.40538  normal  0.056072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2480  hypothetical protein  24.55 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1798  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.145429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1845  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0335  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.91114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1530  hypothetical protein  23.91 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2711  hypothetical protein  24.24 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01920  hypothetical protein  24.82 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2496  hypothetical protein  23.6 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.296365  hitchhiker  0.00398106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2376  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.284586  normal  0.912373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2384  hypothetical protein  23.24 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2306  hypothetical protein  24.24 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05383  hypothetical protein  25.6 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2527  hypothetical protein  22.87 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0998  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0556  putative lipoprotein  24.13 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.921395  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0185  hypothetical protein  25 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0670  hypothetical protein  25.9 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10977  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0228  hypothetical protein  27.62 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000507  hypothetical protein  24.35 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>