51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2437 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  886    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4079  hypothetical protein  31.29 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1213  hypothetical protein  34.48 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3037  hypothetical protein  34.58 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  30 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4427  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  45.95 
 
 		 556 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0002  hypothetical protein  28.42 
 
 		 239 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0817  hypothetical protein  25.62 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194581 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  37.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  33.94 
 
 		 373 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1123  lipase family protein  33.33 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.81089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3597  phospholipase A  33.33 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1175  phospholipase A(1)  33.33 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1461 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7561  hypothetical protein  30.23 
 
 		 141 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0385242  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  32.71 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  29.76 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  34.69 
 
 		 130 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  28.45 
 
 		 328 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2303  hypothetical protein  25.12 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  32.04 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  32.06 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  31.03 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7559  phospholipase A1  27.43 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2344  hypothetical protein  29.5 
 
 		 352 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163785  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  34.75 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  34.02 
 
 		 128 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>