17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1175 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1123  lipase family protein  99.38 
 
 		 320 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.81089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3597  phospholipase A  100 
 
 		 320 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1175  phospholipase A(1)  100 
 
 		 320 aa  655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3681  phospholipase A(1)  57.14 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0179206  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.16 
 
 		 456 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1213  hypothetical protein  36.26 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4079  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3037  hypothetical protein  33.7 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2303  hypothetical protein  30.69 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7559  phospholipase A1  29.55 
 
 		 460 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0817  hypothetical protein  39.77 
 
 		 390 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2719  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 		 796 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  41.24 
 
 		 3026 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.06 
 
 		 928 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>