152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2107 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  81.9 
 
 
438 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  100 
 
 
442 aa  892    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  81.9 
 
 
440 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  84.09 
 
 
441 aa  754    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  95.93 
 
 
442 aa  859    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  48.46 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  47.69 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  47.28 
 
 
447 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  46.77 
 
 
437 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  46.21 
 
 
437 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4223  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  47.32 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298661  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0526  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  50.24 
 
 
447 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214594  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  38 
 
 
451 aa  346  4e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0683  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  39.82 
 
 
445 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.73344  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  38.25 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0437  PTS system, cellobiose-specific IIC component  37.81 
 
 
446 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  37.33 
 
 
448 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3522  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.27 
 
 
432 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1256  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  35.12 
 
 
428 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  33.02 
 
 
427 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.02 
 
 
427 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.02 
 
 
427 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.02 
 
 
427 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.49 
 
 
427 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.49 
 
 
427 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.18 
 
 
428 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.18 
 
 
428 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  33.49 
 
 
427 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.26 
 
 
427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.96 
 
 
437 aa  253  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.87 
 
 
427 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.05 
 
 
428 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.76 
 
 
436 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.17 
 
 
436 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.94 
 
 
436 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.76 
 
 
436 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.76 
 
 
436 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  34.76 
 
 
436 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.76 
 
 
436 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.71 
 
 
436 aa  247  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.71 
 
 
436 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2996  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.74 
 
 
433 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00652008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  34.49 
 
 
434 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.45 
 
 
435 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.75 
 
 
433 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0534  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.44 
 
 
438 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.43 
 
 
434 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  33.48 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.22 
 
 
435 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.43 
 
 
434 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  33.88 
 
 
433 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.52 
 
 
433 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.43 
 
 
434 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.07 
 
 
433 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.85 
 
 
440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.29 
 
 
433 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.97 
 
 
433 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.04 
 
 
451 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.91 
 
 
433 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.91 
 
 
433 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.84 
 
 
433 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.84 
 
 
433 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.07 
 
 
433 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.18 
 
 
435 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.18 
 
 
435 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.18 
 
 
435 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.18 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.18 
 
 
435 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  29.4 
 
 
453 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D01  cellobiose-specific PTS system IIC component  31.85 
 
 
568 aa  223  6e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2221  PTS system, lactose-specific IIC subunit  31.25 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2260  PTS system, lactose-specific IIC subunit  31.25 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.71 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1201  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.63 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1790  PTS system, lactose-specific IIBC components  29.31 
 
 
582 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1851  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.51 
 
 
494 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000119261  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3458  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.21 
 
 
546 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  30.09 
 
 
438 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.91 
 
 
446 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.61 
 
 
420 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0501  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.33 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.87 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.9 
 
 
445 aa  200  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1676  cellobiose-specific PTS system IIC component  28.7 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.486485  normal  0.0322753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.96 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1618  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.94 
 
 
437 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  27.03 
 
 
450 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1427  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.32 
 
 
452 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1442  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.32 
 
 
452 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.32 
 
 
452 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.32 
 
 
452 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2031  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.32 
 
 
452 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1895  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.54 
 
 
452 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.677807  normal  0.163487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01706  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIC component of PTS  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1905  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01694  hypothetical protein  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1819  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.687565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1958  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.54 
 
 
452 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.262654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2455  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  29.54 
 
 
452 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.7631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>