152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1905 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01706  N,N'-diacetylchitobiose-specific enzyme IIC component of PTS  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1905  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01694  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1707  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  88.72 
 
 
452 aa  801    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1092  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  79.25 
 
 
453 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0153711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1819  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.687565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1958  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0835  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  80.79 
 
 
453 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098923 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3569  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  79.25 
 
 
453 aa  729    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000103211  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1145  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  79.25 
 
 
453 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1895  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  99.78 
 
 
452 aa  885    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.677807  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1454  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  100 
 
 
452 aa  888    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.262654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1427  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  94.47 
 
 
452 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1442  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  94.69 
 
 
452 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1410  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  94.91 
 
 
452 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  0.0748148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1858  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  94.91 
 
 
452 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.98931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2031  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  94.91 
 
 
452 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2455  PTS system N,N'-diacetylchitobiose-specific transporter subunit IIC  99.78 
 
 
452 aa  887    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.7631  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1979  N,N'-diacetylchitobiose permease IIC component  99.6 
 
 
253 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.367022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3753  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.44 
 
 
435 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.74 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5320  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.85 
 
 
435 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5629  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.03 
 
 
434 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000203368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5299  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.96 
 
 
434 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000370618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5058  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  35.7 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5443  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  35.7 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5375  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.98 
 
 
435 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4903  PTS system, cellobiose-specific IIC component  35.92 
 
 
435 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5003  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  35.48 
 
 
435 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4888  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.43 
 
 
434 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1738  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  37.02 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1634  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.79 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1619  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  36.57 
 
 
437 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0199  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  36.12 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5063  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.55 
 
 
433 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5448  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  33.55 
 
 
433 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2601  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIC component  33.48 
 
 
450 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4908  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.33 
 
 
433 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5304  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.33 
 
 
433 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5335  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.55 
 
 
433 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5006  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32.97 
 
 
433 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5382  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.91 
 
 
433 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.12 
 
 
433 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000179415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2668  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.11 
 
 
438 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4895  PTS system, cellobiose-specific IIC component  33.33 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2981  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  32 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299528  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3346  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  34.48 
 
 
440 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2135  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  33.61 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5325  PTS system, cellobiose-specific IIC component  32.46 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0181  cellobiose-specific PTS system IIC component  31.2 
 
 
494 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.113932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2496  PTS system, cellobiose-specific IIC component, putative  30.44 
 
 
427 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0934011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2418  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.44 
 
 
427 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2559  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.44 
 
 
427 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2270  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.44 
 
 
427 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0195  cellobiose-specific PTS system IIC component  32.7 
 
 
476 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0622401  normal  0.284293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2291  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.71 
 
 
428 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2254  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  31.33 
 
 
427 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.716734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2463  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  31.71 
 
 
428 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2480  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.33 
 
 
427 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0736  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.38 
 
 
448 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2912  putative PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.56 
 
 
427 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.813748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03624  PTS system, cellobiose-specific IIC component  31.86 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2212  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIC component  30.89 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4490  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0884  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0754  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.26 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0702  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0793  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIC  30.26 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0704  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.04 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0262  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  34.26 
 
 
428 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0955  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0689  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0846  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.26 
 
 
436 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2139  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  28.72 
 
 
451 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00121046  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0330  PTS system, cellobiose-specific IIC component  34.29 
 
 
433 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3870  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.16 
 
 
420 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.448172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002436  PTS system cellobiose-specific IIC component  30.68 
 
 
444 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3200  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  32.29 
 
 
441 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0768  PTS system, cellobiose-specific IIC subunit  32.83 
 
 
448 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3469  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.99 
 
 
445 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.868513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2306  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.39 
 
 
437 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000207332  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B04  chitibiose transporter protein chbC  31.88 
 
 
440 aa  189  9e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.163896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1790  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30.33 
 
 
427 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0009  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.65 
 
 
437 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2107  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  29.54 
 
 
442 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3282  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  31.95 
 
 
445 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1858  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  30 
 
 
453 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0468  cellobiose-specific PTS system IIC component  29.19 
 
 
445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00462633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0343  cellobiose-specific PTS system IIC component  31.35 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000855206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0570  cellobiose-specific PTS system IIC component  30.43 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.976789  normal  0.163994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0756  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.16 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1823  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  28.88 
 
 
442 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0034  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  30.39 
 
 
438 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0029  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31 
 
 
440 aa  183  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3121  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31 
 
 
429 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0071332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0703  PTS system, cellobiose permease IIC component  33.74 
 
 
428 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0010  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.44 
 
 
437 aa  180  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0672  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  31.12 
 
 
434 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0901  PTS system, cellobiose-specific IIC component  30.02 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0037  PTS system lactose/cellobiose family IIC subunit  28.79 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.908472  normal  0.420759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>