34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4582 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  43.45 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  48.95 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  44.37 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  41.96 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  41.96 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  43.88 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  41.84 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  41.84 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  41.35 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  39.58 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 319 aa  84.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.5 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  35.56 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  35.25 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  31.39 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2653  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  0.824107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1843  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.527811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  32.85 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2664  Polyketide cyclase/dehydrase  33.59 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0293  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  26.97 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  26.21 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3746  hypothetical protein  30.38 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  31.58 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  30.07 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0193  hypothetical protein  26.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  28.06 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3350  hypothetical protein  32.05 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>