More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3226 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 373 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  74.07 
 
 		 378 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  58.36 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  59.26 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  58.68 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.16 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  57.29 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  55.65 
 
 		 379 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  60.74 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  56.42 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  56.25 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.95 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.69 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 390 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.45 
 
 		 400 aa  342  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 396 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  48.22 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.59 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.28 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  47.79 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 		 384 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.27 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  44.1 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 		 391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.03 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 		 394 aa  311  9e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  45.65 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  44.13 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  44.62 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  45.99 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.15 
 
 		 424 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  44.63 
 
 		 412 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.45 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.99 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.18 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 400 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.54 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  45.57 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  45.09 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.38 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 398 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 		 390 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  45.69 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.45 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.41 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.19 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>