More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1803 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 405 aa  826    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  58.91 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  59.31 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  59.06 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  50 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  50.61 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  45.71 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  48.66 
 
 		 413 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  44.2 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  45.24 
 
 		 410 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  44.5 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  47.92 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  42.71 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  44.75 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  45.92 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  39.76 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  43.87 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 		 428 aa  308  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  45.9 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  41.5 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  42.75 
 
 		 432 aa  302  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 		 415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  40.05 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  39.81 
 
 		 437 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  42.01 
 
 		 369 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 518 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  40.74 
 
 		 460 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  40.6 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  39.1 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  41.16 
 
 		 412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  41.06 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  35.64 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  29.39 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.2 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 188 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 188 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.78 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.78 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.78 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.24 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.63 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.25 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.97 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.19 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.73 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  39.84 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.11 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  30.73 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.85 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.19 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.99 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>