37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0269 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  61.32 
 
 		 358 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  56.19 
 
 		 423 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  53.7 
 
 		 640 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  47.37 
 
 		 476 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  50.86 
 
 		 611 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  51.35 
 
 		 360 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  51.35 
 
 		 360 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  50.45 
 
 		 360 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  49.12 
 
 		 278 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  48.25 
 
 		 278 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  50.91 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  48.54 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  48.65 
 
 		 238 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  49.54 
 
 		 544 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  50.49 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  47.96 
 
 		 555 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  47.96 
 
 		 555 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  47.96 
 
 		 555 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  45.92 
 
 		 555 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  42.34 
 
 		 235 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  46.15 
 
 		 336 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  44.55 
 
 		 150 aa  93.6  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  44.74 
 
 		 246 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  44.25 
 
 		 608 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  44.44 
 
 		 233 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  46.85 
 
 		 433 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  46.85 
 
 		 433 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  44.86 
 
 		 455 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  44.07 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  41.23 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  40.91 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  29.09 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  37 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  32.86 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>