More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0248 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0248  ABC transporter related  100 
 
 		 479 aa  946    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.752958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  62.77 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.97 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  45.67 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  44.88 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.88 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.97 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.75 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.53 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  41.04 
 
 		 500 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.75 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.53 
 
 		 512 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.53 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  43.63 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  45.76 
 
 		 497 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.1 
 
 		 513 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  43.7 
 
 		 507 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  44.25 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.92 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.11 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.99 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.61 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  44.61 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.92 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  41.58 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  43.04 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.98 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.91 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  43.55 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.83 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.94 
 
 		 508 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.15 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  43.47 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  44.33 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  42.6 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  44.05 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.94 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.77 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.49 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  44.07 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  42.21 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  43.13 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.94 
 
 		 520 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.56 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.48 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.66 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.52 
 
 		 507 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.99 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.81 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.51 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.83 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 506 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.86 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.92 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 502 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.41 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 517 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.31 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.22 
 
 		 501 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  42.21 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.36 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 506 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  39.43 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  44.49 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  40.65 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>