36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1543 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  95 
 
 		 240 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  55.13 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  54.85 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  37.91 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  37.12 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  40.62 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  36.2 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  31.47 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  31.47 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  30.73 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  33.53 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  33.53 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  33.82 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  34.39 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  30.86 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.3 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.3 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  30.86 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  33.71 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  31.22 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  35.56 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  35.56 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  35.56 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  34.3 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  31.91 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  26.77 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  26.44 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  24.55 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  24.6 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.48 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  28.51 
 
 		 386 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>