267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2754 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2754  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.22 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  41.77 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  43.57 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1610  dihydrofolate reductase region  38.16 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 195 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.06 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  38.27 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.31 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  38.24 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  39.35 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  43.06 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  39.33 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  38.16 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  40.3 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  42.25 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  40.12 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  36 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  43.7 
 
 		 219 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  36.97 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  40.62 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  38.51 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  42.22 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  37.42 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  39.73 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  39.57 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  39.73 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  39.73 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  38 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  39.57 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  41.79 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2031  Dihydrofolate reductase  43.85 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00277782  hitchhiker  0.0000505034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  45.19 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  39.86 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  41.04 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  34.59 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  45.19 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  41.48 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  38.6 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  35.15 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  40.28 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.03 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  41.06 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 195 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  37.72 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  35.85 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  36.71 
 
 		 292 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  38.41 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.54 
 
 		 167 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  33.54 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  34.16 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  43.94 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.45 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  38.81 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  42.55 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 209 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  34.59 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  37.58 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  43.75 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  44.44 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>