More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1918 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  62.16 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  61.08 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  235  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  57.06 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 186 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  57.23 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  54.64 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  55.19 
 
 		 186 aa  214  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 183 aa  214  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 184 aa  214  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 184 aa  207  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  207  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 184 aa  205  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 187 aa  204  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2111  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.274571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0341  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  53.3 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  54.34 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1226  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.125254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5315  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2582  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.336075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4945  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2602  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 189 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2175  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  51.1 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  51.65 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  52.2 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2280  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 186 aa  194  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.704245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  48.66 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>