More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1731 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  55.54 
 
 		 558 aa  652    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  100 
 
 		 570 aa  1188    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  58.98 
 
 		 570 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  56.89 
 
 		 567 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3640  phosphorylase  54.13 
 
 		 558 aa  632  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.373302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  52.63 
 
 		 563 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0543  alpha-glucan phosphorylase  51.52 
 
 		 578 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  51.05 
 
 		 561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4427  alpha-glucan phosphorylase  51.5 
 
 		 566 aa  541  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.826704  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  48.21 
 
 		 538 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1065  alpha-glucan phosphorylase  41.7 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00035073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  41.72 
 
 		 855 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  43.87 
 
 		 854 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  40.84 
 
 		 737 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  40.88 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  40.07 
 
 		 849 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  42.42 
 
 		 693 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  41.06 
 
 		 853 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  39.42 
 
 		 853 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  42.81 
 
 		 854 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  41.45 
 
 		 850 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  39.65 
 
 		 703 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  40.73 
 
 		 844 aa  405  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  41.17 
 
 		 850 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  39.49 
 
 		 706 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  41.07 
 
 		 854 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  40.7 
 
 		 823 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  41.72 
 
 		 854 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  39.78 
 
 		 703 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  39.65 
 
 		 704 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  41 
 
 		 854 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  39.58 
 
 		 855 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  38.62 
 
 		 848 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  40.26 
 
 		 719 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  39.34 
 
 		 705 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  40.13 
 
 		 861 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  38.21 
 
 		 712 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  40.98 
 
 		 716 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  38.95 
 
 		 847 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  38.44 
 
 		 832 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  40.19 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  39.71 
 
 		 842 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  38.95 
 
 		 706 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  39.58 
 
 		 838 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  40.46 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  39.65 
 
 		 858 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  39.64 
 
 		 849 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  37.6 
 
 		 854 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  41.1 
 
 		 854 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  37.99 
 
 		 852 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  38.83 
 
 		 854 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  38.54 
 
 		 713 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  38.67 
 
 		 856 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  40.03 
 
 		 690 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  38.29 
 
 		 855 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  37.54 
 
 		 748 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  37.75 
 
 		 862 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  36.9 
 
 		 729 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  37.93 
 
 		 717 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  37.8 
 
 		 719 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  38.18 
 
 		 877 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  38.78 
 
 		 694 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  38.44 
 
 		 851 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  37.22 
 
 		 860 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  38.38 
 
 		 858 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  39.84 
 
 		 853 aa  361  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  38.73 
 
 		 850 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  38.41 
 
 		 849 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  38.2 
 
 		 871 aa  359  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  38.03 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  37.57 
 
 		 541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  36.33 
 
 		 1413 aa  356  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  37.62 
 
 		 858 aa  355  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  37.8 
 
 		 850 aa  354  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  36.87 
 
 		 875 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  38.1 
 
 		 854 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  37.84 
 
 		 863 aa  353  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  38.89 
 
 		 856 aa  352  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  38.56 
 
 		 849 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  37.18 
 
 		 737 aa  349  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  37.32 
 
 		 850 aa  349  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  36.7 
 
 		 540 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1428  alpha-glucan phosphorylase  36.36 
 
 		 834 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  36.75 
 
 		 860 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  37.07 
 
 		 856 aa  346  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  36.59 
 
 		 860 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  36.59 
 
 		 860 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  36.06 
 
 		 881 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  37.64 
 
 		 857 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  37.75 
 
 		 835 aa  343  5.999999999999999e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  35.82 
 
 		 535 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  36.19 
 
 		 863 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  35.96 
 
 		 841 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  37.4 
 
 		 873 aa  341  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  36.6 
 
 		 863 aa  342  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  35.96 
 
 		 841 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  36.74 
 
 		 856 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  37.62 
 
 		 1421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  35.4 
 
 		 713 aa  339  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  36.94 
 
 		 862 aa  339  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>