49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0499 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0499  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0726  SH3 type 3 domain protein  35.53 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1489  SH3 type 3 domain-containing protein  26.85 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3683  SH3 type 3 domain-containing protein  29.11 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2532  hypothetical protein  29.32 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1715  SH3 domain-containing protein  29.78 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2044  hypothetical protein  26.82 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.74668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0747  SH3 type 3 domain protein  27.78 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.737652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2333  SH3-like region  26.76 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0682642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1880  SH3 type 3 domain-containing protein  27.44 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1504  SH3-like region  30.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3625  SH3 type 3 domain-containing protein  26.17 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000261951  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03714  SH3, type 3  25 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000284257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3845  SH3 domain-containing protein  26.98 
 
 		 181 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000383374  hitchhiker  0.0000000226441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2347  hypothetical protein  28.16 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00861  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0690  SH3, type 3  30.19 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000176512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3489  SH3 type 3 domain-containing protein  24.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0715  SH3 type 3 domain-containing protein  24.06 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3852  SH3, type 3  26.7 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000664747  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0365  hypothetical protein  34.38 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  39.34 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4292  putative signal transduction protein  31.9 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000541961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2021  hypothetical protein  24.1 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0915  SH3 type 3 domain-containing protein  26.7 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000529775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1192  hypothetical protein  26.61 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  35.38 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2675  SH3 domain-containing protein  23.96 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2683  hypothetical protein  23.65 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0905  SH3 type 3 domain protein  22.76 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000893023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0820  SH3 type 3 domain-containing protein  25.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0567  SH3 type 3 domain-containing protein  25.69 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  35.38 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3121  SH3 domain-containing protein  25.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.278206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3457  SH3 type 3 domain-containing protein  24.64 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000152698  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0851  SH3 domain-containing protein  25.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4197  hypothetical protein  21.86 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0933  hypothetical protein  28.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10220  SH3 domain-containing protein  28.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  41.3 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0179  SH3 type 3 domain-containing protein  20.26 
 
 		 189 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  30.99 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2081  hypothetical protein  27.07 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  30.99 
 
 		 181 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.46 
 
 		 476 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0797  putative signal transduction protein  24.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0831  putative signal transduction protein  27.47 
 
 		 205 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.17 
 
 		 370 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>