75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1858 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  100 
 
 		 524 aa  1037    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  44.78 
 
 		 523 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1943  ATPase  44.56 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.587571  hitchhiker  0.00000000309284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.13 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.57 
 
 		 748 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.2 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  26.47 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  28.35 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  28.35 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.35 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.67 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  28.57 
 
 		 599 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.56 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.27 
 
 		 732 aa  62  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  32.58 
 
 		 609 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  32.58 
 
 		 609 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  25.5 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.64 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  28.43 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  23.87 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  27.17 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.88 
 
 		 765 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  29.38 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  31.58 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  28.3 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  25.12 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  31.64 
 
 		 734 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  32.2 
 
 		 781 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  34.26 
 
 		 666 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  30.18 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.71 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.53 
 
 		 568 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.81 
 
 		 698 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.43 
 
 		 410 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.05 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.95 
 
 		 590 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.56 
 
 		 510 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.9 
 
 		 853 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.25 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  28.22 
 
 		 587 aa  50.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1024  ATPase  33.65 
 
 		 668 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  32.38 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.96 
 
 		 795 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.49 
 
 		 754 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  29.24 
 
 		 310 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  26.63 
 
 		 513 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  29.38 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  28.65 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.26 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  28.81 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  28.81 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0475  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.86 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1956  ATPase  34.38 
 
 		 938 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  27.05 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  28.65 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 723 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  28.81 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.44 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.88 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  30.1 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  30.61 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.68 
 
 		 722 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.65 
 
 		 309 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  28.81 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  26.13 
 
 		 513 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  29.53 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.72 
 
 		 605 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  27.38 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  32.97 
 
 		 696 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.53 
 
 		 321 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  25.67 
 
 		 369 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  26.53 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.8 
 
 		 585 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  31.87 
 
 		 900 aa  43.9  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>