55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1425 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  100 
 
 		 362 aa  726    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  40.69 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  31.1 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.4 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  28.63 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  29.62 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.63 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  30.37 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  27.34 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.37 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.19 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  27.02 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.86 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.24 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.11 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  29.08 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  26.57 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  27.95 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  30.65 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  28.29 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  28.21 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  27.61 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  27.54 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  27.54 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  27.93 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  28.05 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  27.46 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.47 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.78 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.09 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  27.12 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  29.2 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  28.08 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  33.33 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.3 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.37 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  27.36 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  27.36 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.99 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  27.04 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  36.63 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  24.5 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.54 
 
 		 418 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  21.01 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.03 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.93 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.14 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  22.73 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  21.15 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  20.56 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  22.92 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  22.92 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  24.28 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>