More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1336 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 171 aa  330  6e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  77.65 
 
 		 172 aa  254  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  73.53 
 
 		 176 aa  247  6e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  74.21 
 
 		 177 aa  245  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  35.47 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  34.16 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 184 aa  100  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 		 281 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  41.25 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 215 aa  97.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 201 aa  97.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.41 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.4 
 
 		 194 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  39.86 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  39.16 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  31.98 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  38.56 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  38.27 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 180 aa  94  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 		 183 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  38.46 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  38.18 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  42.18 
 
 		 210 aa  91.3  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  31.4 
 
 		 214 aa  90.9  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  33.53 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  44.29 
 
 		 215 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 209 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 211 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 184 aa  87.8  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 204 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.72 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  37.13 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  36.65 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>