89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1296 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  66.85 
 
 
534 aa  669    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  100 
 
 
537 aa  1066    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  68.61 
 
 
533 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  42.27 
 
 
595 aa  458  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  28.87 
 
 
521 aa  174  5e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  26.92 
 
 
600 aa  168  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  26.33 
 
 
609 aa  140  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3912  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.57 
 
 
579 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2056  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.88 
 
 
552 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.98 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.72 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.88 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.72 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12532  hypothetical protein  27.04 
 
 
533 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.91 
 
 
526 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.57 
 
 
505 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.6 
 
 
529 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  27.27 
 
 
508 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.86 
 
 
513 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.55 
 
 
515 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2013  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.17 
 
 
533 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.98 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.43 
 
 
499 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1954  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.27 
 
 
525 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  21.42 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  27.17 
 
 
535 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.99 
 
 
520 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  22.62 
 
 
499 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  27.22 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.5 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.18 
 
 
608 aa  55.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2235  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.8 
 
 
514 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173047  normal  0.0160652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1987  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.07 
 
 
520 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155203  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  26.01 
 
 
540 aa  53.9  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  30.94 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2387  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.14 
 
 
520 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  20.15 
 
 
524 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  21.03 
 
 
523 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.84 
 
 
524 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4415  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.12 
 
 
521 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.763813  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  40 
 
 
779 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  36.99 
 
 
516 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.79 
 
 
605 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  25.14 
 
 
511 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  30.2 
 
 
501 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  21.59 
 
 
524 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3308  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  43.33 
 
 
494 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2668  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.48 
 
 
504 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3566  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.3 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  34.62 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  24.34 
 
 
643 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0459  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.67 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1012  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  41.67 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4442  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  41.67 
 
 
491 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.905304  hitchhiker  0.0000193157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0459  hypothetical protein  28.3 
 
 
493 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1372  hypothetical protein  41.67 
 
 
491 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4351  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  41.67 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.012441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0463  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.3 
 
 
497 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.2 
 
 
503 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1337  hypothetical protein  23.98 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4430  hypothetical protein  41.67 
 
 
495 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  30.39 
 
 
521 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.19 
 
 
492 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1336  hypothetical protein  30.22 
 
 
509 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3379  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.38 
 
 
496 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55980  hypothetical protein  41.67 
 
 
496 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0734375  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  28.4 
 
 
570 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.05 
 
 
531 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  26.21 
 
 
608 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.17 
 
 
511 aa  44.3  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4519  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000859541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4875  hypothetical protein  41.67 
 
 
496 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  26.21 
 
 
608 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3734  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.600698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04129  predicted ATPase  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.431713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1668  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.16 
 
 
498 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04093  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3727  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  37.66 
 
 
493 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4744  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0318785  normal  0.98435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5785  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00669177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  32.03 
 
 
515 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4817  hypothetical protein  30.71 
 
 
500 aa  43.9  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00312271  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  25.58 
 
 
616 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  33.77 
 
 
514 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2862  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  33.77 
 
 
501 aa  43.5  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  28.86 
 
 
463 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  29.66 
 
 
463 aa  43.5  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  21.8 
 
 
526 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3654  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  36.36 
 
 
500 aa  43.5  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>