141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1954 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  63.81 
 
 		 505 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2189  hypothetical protein  64.87 
 
 		 535 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1702  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  73.41 
 
 		 502 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2668  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  74.32 
 
 		 504 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  67.05 
 
 		 511 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1993  hypothetical protein  63.12 
 
 		 508 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  69.25 
 
 		 526 aa  692    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1966  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  72.69 
 
 		 505 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  68.48 
 
 		 511 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3204  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  74.76 
 
 		 507 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1727  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  73.08 
 
 		 505 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  74.14 
 
 		 503 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1336  hypothetical protein  79.62 
 
 		 509 aa  810    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1987  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  64.77 
 
 		 520 aa  690    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3520  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  71.68 
 
 		 508 aa  727    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227605  normal  0.161748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1954  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  100 
 
 		 525 aa  1046    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2387  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  64.72 
 
 		 520 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4836  hypothetical protein  60.46 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000653742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  59.93 
 
 		 541 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2221  hypothetical protein  63.97 
 
 		 497 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1668  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  59.58 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3654  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  60.46 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4519  hypothetical protein  60.27 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000859541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3749  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  60.27 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4817  hypothetical protein  60.27 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00312271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04129  predicted ATPase  59.89 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.431713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3734  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  59.89 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.600698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04093  hypothetical protein  59.89 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4744  hypothetical protein  59.89 
 
 		 500 aa  597  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0318785  normal  0.98435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5785  hypothetical protein  59.7 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00669177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4584  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  61.49 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3949  hypothetical protein  62.57 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3706  hypothetical protein  62.18 
 
 		 513 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0243  putative NPT hydrolase  62.38 
 
 		 513 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0650533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3727  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  57.09 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0088  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  61.46 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0767  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  59.49 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0732  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  59.42 
 
 		 488 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0114727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  57.66 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2631  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  56.6 
 
 		 522 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1768  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  55.12 
 
 		 522 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.307535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  57.52 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0858  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  56.87 
 
 		 514 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.48 
 
 		 521 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2697  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  57.2 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.51 
 
 		 565 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1204  hypothetical protein  54.78 
 
 		 527 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  65.1 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4415  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.29 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.763813  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  57.84 
 
 		 515 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  57.25 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.06 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3029  hypothetical protein  53.42 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.998506  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  63.86 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2047  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.79 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  63.12 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1936  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  53.59 
 
 		 536 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.93 
 
 		 490 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  55.11 
 
 		 520 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0107  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  56.93 
 
 		 490 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  53.35 
 
 		 521 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  53.05 
 
 		 536 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0823  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  54.26 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  52.89 
 
 		 463 aa  508  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  52.69 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0563  hypothetical protein  55.17 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  52.75 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  56.01 
 
 		 544 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0564  hypothetical protein  54.93 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2524  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  50.97 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2150  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  60.73 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.56752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1614  hypothetical protein  51.95 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2862  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  52.4 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  60.64 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1636  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  55.62 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.985803  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3379  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.35 
 
 		 496 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  47.73 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3826  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  50.87 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1380  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.15 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141103  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3899  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  50.97 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4022  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  50.97 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0435  hypothetical protein  50.48 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1551  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  50.8 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0463  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.69 
 
 		 497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3566  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.89 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0459  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  51.49 
 
 		 497 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1312  hypothetical protein  50.1 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0459  hypothetical protein  51.09 
 
 		 493 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4430  hypothetical protein  50 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55980  hypothetical protein  50.1 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0734375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4875  hypothetical protein  50.1 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1372  hypothetical protein  48.81 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4442  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  49.01 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.905304  hitchhiker  0.0000193157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1012  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  48.13 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4351  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  48.42 
 
 		 491 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.012441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3308  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  49.8 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42 
 
 		 523 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  47.1 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  44.91 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  44.63 
 
 		 520 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>