31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0856 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0856  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 94 aa  182  9e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.917822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  70.97 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  57.61 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  46.67 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  48.05 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  39.78 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  44.16 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1363  nucleotidyltransferase, putative  40.98 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00238094  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1536  hypothetical protein  39.19 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.851535  normal  0.0721656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1359  nucleotidyltransferase, putative  37.5 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3091  DNA polymerase, beta-like region  35.53 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4067  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1686  DNA polymerase beta subunit  45.16 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000153026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1812  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  38.03 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  30.49 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1655  DNA polymerase beta domain protein region  27.85 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1866  DNA polymerase beta domain protein region  35.82 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  42.25 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 110 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  35.94 
 
 		 121 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 118 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0897  DNA polymerase beta subunit  27.91 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0104  DNA polymerase beta domain protein region  40.35 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  38.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2571  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0855  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 107 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.725816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>