293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3565 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3565  5'-nucleotidase-like  100 
 
 
491 aa  1005    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3839  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.53 
 
 
502 aa  329  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0174247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  27.56 
 
 
517 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  27.35 
 
 
505 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  30.2 
 
 
512 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  26.92 
 
 
500 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.35 
 
 
505 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  27.99 
 
 
506 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.93 
 
 
508 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 
523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.02 
 
 
605 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.17 
 
 
607 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.6 
 
 
518 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.6 
 
 
518 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.6 
 
 
518 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  25 
 
 
666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.4 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  24.63 
 
 
504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.4 
 
 
518 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.39 
 
 
659 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  25.96 
 
 
663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.41 
 
 
539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.54 
 
 
657 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.22 
 
 
627 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.37 
 
 
508 aa  123  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  24.54 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  22.71 
 
 
638 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  24.38 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.85 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.22 
 
 
1284 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.85 
 
 
517 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.85 
 
 
509 aa  113  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.78 
 
 
872 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  24.69 
 
 
558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.83 
 
 
1215 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.83 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.23 
 
 
1202 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05655  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01160)  24.18 
 
 
498 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  24.49 
 
 
520 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.36 
 
 
508 aa  107  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.36 
 
 
508 aa  107  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.52 
 
 
530 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.01 
 
 
516 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.43 
 
 
555 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  24.08 
 
 
529 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  23.67 
 
 
529 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  23.67 
 
 
529 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.38 
 
 
523 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  23.67 
 
 
529 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  23.88 
 
 
529 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  23.53 
 
 
529 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  23.53 
 
 
529 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  25.1 
 
 
556 aa  100  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.39 
 
 
515 aa  100  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.7 
 
 
772 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.16 
 
 
489 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.7 
 
 
772 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.98 
 
 
529 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  23.38 
 
 
523 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  23.33 
 
 
529 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.67 
 
 
529 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.88 
 
 
529 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  23.53 
 
 
529 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  23.53 
 
 
529 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  23.33 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  23.33 
 
 
529 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  22.92 
 
 
529 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.48 
 
 
1525 aa  94  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.93 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1473  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.19 
 
 
494 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.92 
 
 
503 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  21.81 
 
 
1512 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04020  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
788 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.43338  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  23.32 
 
 
698 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.67 
 
 
722 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  21.29 
 
 
533 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  22.43 
 
 
1506 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  21.89 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  21.67 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  21.67 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  21.67 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.6 
 
 
1181 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0615  5'-Nucleotidase domain protein  23.03 
 
 
700 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.6 
 
 
1175 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  30.1 
 
 
560 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.41 
 
 
517 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  23.25 
 
 
619 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.67 
 
 
535 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  24.35 
 
 
580 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.79 
 
 
578 aa  77  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  25.97 
 
 
559 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0338  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  23.63 
 
 
519 aa  75.5  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  22.44 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3996  metallophosphoesterase  23.78 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>