More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3485 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.38 
 
 
236 aa  242  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
240 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.54 
 
 
240 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  44.64 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.06 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.49 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
240 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.3 
 
 
240 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.54 
 
 
240 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
240 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  44.2 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
240 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.96 
 
 
235 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.78 
 
 
231 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 
240 aa  158  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.12 
 
 
233 aa  154  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.22 
 
 
228 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.84 
 
 
235 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  37.39 
 
 
243 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.07 
 
 
235 aa  138  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.6 
 
 
250 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.91 
 
 
250 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  36.97 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.33 
 
 
245 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.9 
 
 
247 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.87 
 
 
236 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.26 
 
 
233 aa  118  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.62 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.51 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.2 
 
 
249 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  33.19 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.78 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  35.78 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.19 
 
 
239 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.19 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.48 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.25 
 
 
242 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.19 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.77 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.05 
 
 
245 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.51 
 
 
273 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.19 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.31 
 
 
237 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.94 
 
 
244 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.97 
 
 
291 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.28 
 
 
292 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 
236 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
259 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.69 
 
 
287 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
257 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 
239 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.51 
 
 
287 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.1 
 
 
287 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.9 
 
 
247 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.34 
 
 
631 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.69 
 
 
247 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.1 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.1 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.51 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.67 
 
 
273 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.63 
 
 
242 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.49 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  29.87 
 
 
240 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.47 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.1 
 
 
287 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.9 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.47 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.47 
 
 
247 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.47 
 
 
247 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  32.47 
 
 
247 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2048  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.63 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.33 
 
 
278 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.79 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.05 
 
 
594 aa  98.2  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.3 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  38.86 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.47 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2170  putative phosphodiesterase  29.87 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.78 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.47 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  30.04 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.1 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.03 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.02 
 
 
279 aa  97.1  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.96 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.96 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.14 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3017  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.76 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.96 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.17 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.04 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.19 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>