41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3458 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3458  GrxB family glutaredoxin  100 
 
 		 231 aa  481  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2798  glutaredoxin 2  46.76 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.848662  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  43.98 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2207  glutaredoxin 2  48.37 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.158739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2023  glutaredoxin 2  48.37 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1233  glutaredoxin 2  48.37 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.25689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  48.37 
 
 		 215 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1277  glutaredoxin 2  47.91 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.525696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  43.52 
 
 		 215 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1801  glutaredoxin 2  45.12 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1578  glutaredoxin 2  46.92 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2582  glutaredoxin, GrxB family  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1443  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.89922  hitchhiker  0.00478743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2262  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2065  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2536  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.154666  normal  0.170282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01068  hypothetical protein  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.557548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1187  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1187  glutaredoxin 2  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01060  glutaredoxin 2 (Grx2)  46.05 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.762215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2078  glutaredoxin 2  44.65 
 
 		 215 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1961  glutaredoxin 2  38.71 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2549  glutaredoxin 2  39.44 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3221  glutaredoxin 2  39.07 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1106  glutaredoxin 2  38.14 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  34.26 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38124  predicted protein  34.62 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06497  glutaredoxin 2  29.72 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000623  glutaredoxin 2  31.13 
 
 		 209 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0245  glutaredoxin 2  30.65 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0190  Glutaredoxin 2-like protein  24.22 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.68 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  24.87 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  28.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  21.9 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.87 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  30.26 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  29.87 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 213 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.04 
 
 		 230 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2771  Glutathione S-transferase domain protein  22.33 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>