32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3280 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  36.74 
 
 		 415 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.8 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  31.43 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  38.27 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  38.27 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  34.17 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  38.27 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  38.27 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  37.04 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  32.74 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  30.65 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  43.08 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  43.08 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  35.8 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  35.8 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  35.8 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  30.36 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  35.11 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  27.5 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  31.86 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  29.13 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0178  general secretion pathway protein B  27.43 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.953003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  36 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1409  general secretion pathway protein  30.56 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  33.33 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2864  general secretion pathway protein  30.56 
 
 		 190 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22870  hypothetical protein  34.33 
 
 		 234 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  30.77 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  34.85 
 
 		 269 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>